Kırıkkale Üniversitesi bünyesinde 3 Temmuz 1992 tarihinde üniversitemizin kuruluşu ile birlikte kurulan fakültemizde; sırasıyla 1992 yılında Makine Mühendisliği, 1994 yılında İnşaat Mühendisliği, 1995 yılında Elektrik-Elektronik Mühendisliği, 1998 yılında Endüstri Mühendisliği, 2009 yılında Bilgisayar Mühendisliği, 2012 yılında Metalurji ve Malzeme Mühendisliği, 2013 yılında Biyomühendislik bölümleri kurulmuştur. Fakültemizin ismi 04 Ağustos 2023 tarih ve 32269 sayılı Resmi Gazetede yayınlanarak Mühendislik ve Doğa Bilimleri Fakültesi olarak değişmiştir. Değişiklik kararının ardından Üniversitemizin kapatılan Fen Edebiyat Fakültesindeki Biyoloji Bölümü, Fizik Bölümü, Kimya Bölümü, Matematik Bölümü ile İstatistik Bölümü Fakültemiz bünyesine katılmışlardır. 

Bölümlerimiz;

• Makine Mühendisliği Bölümü

• İnşaat Mühendisliği Bölümü

• Elektrik-Elektronik Mühendisliği Bölümü

• Endüstri Mühendisliği Bölümü

• Bilgisayar Mühendisliği Bölümü

• Metalurji ve Malzeme Mühendisliği Bölümü

• Biyomühendislik Bölümü

• Mimarlık Bölümü

• Biyoloji Bölümü

• Fizik Bölümü

• Kimya Bölümü

• Matematik Bölümü

• İstatistik Bölümü